Koyré nasceu na cidade de Taganrog no seio de uma família russa de origem judaica.
Em Göttingen, na Alemanha, ele estudou com Edmund Husserl e David Hilbert. Husserl não aprovou a dissertação de Koyré, após o que este partiu para Paris. Depois das Meditações cartesianas de Husserl, uma série de conferências proferidas em Paris e um dos mais importantes trabalhos tardios deste filósofo, Koyré encontrou-se repetidamente com ele e influenciou a sua compreensão de Galileo Galilei.
Em Paris, Koyré tornou-se colega de Alexandre Kojève, e ensinou na École Pratique des Hautes Études. Embora mais conhecido como filósofo da ciência, Koyré iniciou-se como historiador da religião. Muita da sua originalidade veio a apoiar-se na capacidade de basear os seus estudos sobre ciência moderna na história da religião e da metafísica.
Koyré centrou-se em Galileo Galilei, Platão, e Isaac Newton. O seu trabalho mais famoso é Do Mundo fechado ao Universo infinito, uma série de conferências apresentadas na The Johns Hopkins University em 1959 sobre a ascensão da ciência moderna e a mudança na percepção científica do mundo no período de Nicolau de Cusa e Giordano Bruno até Isaac Newton. O livro era essencialmente uma síntese das ideias já anteriormente apresentadas por Koyré.
Koyré influenciou muitos filósofos da ciência europeus e americanos, entre os quais Paul Feyerabend e Thomas Kuhn.
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Koyre, Alexandre - Do Mundo Fechado ao Universo Infinito [Forense Universitária]
Koyre, Alexandre - Do Mundo Fechado ao Universo Infinito
Koyre, Alexandre - Galileu e Platão [Gradiva]
Koyre, Alexandre - Introduccion a la Lectura de Platon [ESP]
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